Ученые впервые успешно извлекли молекулы РНК из вымершего вида. Это было достигнуто с тилацином, видом плотоядных сумчатых, который жил в Австралии примерно столетие назад – и может однажды снова появиться, если нынешние планы принесут свои плоды.
Тилацин, когда-то широко распространенный по всей Австралии, последние несколько тысячелетий своего существования обитал изолированно на острове Тасмания. Там он оказался легкой добычей для первых европейских колонизаторов, которые считали его вредителем своих сельскохозяйственных угодий и систематически уничтожали.
Через несколько десятилетий меры государственной защиты в конечном итоге были приняты – но было слишком поздно, и последний известный экземпляр умер в неволе в 1936 году.
Учитывая недавность его исчезновения (и, возможно, изрядную долю вины), тилацин был включен в короткий список видов, подлежащих «воскрешению». Наряду с мамонтом и дронтом (птица Додо), генетическая компания Colossal Biosciences заявила о своем намерении воскресить тилацина с помощью методов генной инженерии.
С этой целью ученым удалось почти полностью реконструировать геном тилацина. Но эта схема ДНК на самом деле является лишь частью биологической головоломки: ученым также нужен ее «транскриптор», или схема РНК, которая подробно описывает, как гены экспрессируются и регулируются в различных тканях организма.
Теперь ученые из Швеции сделали первый шаг к этой цели, извлекая РНК из образца тилацина, хранившегося в музейной коллекции в течение 130 лет. Это не только первый случай для тилацина, но и для любого вымершего вида, поскольку РНК имеет тенденцию очень быстро разлагаться вне живой клетки.
В новом исследовании ученые разработали новый метод извлечения старой РНК, адаптировав методы, обычно используемые для более поздних образцов. При этом им удалось извлечь и очистить сотни миллионов фрагментов РНК из кожи и мышечной ткани тилацина.
После учета дубликатов и непривычно коротких последовательностей они получили 1,5 миллиона последовательностей мышечной РНК и 2,8 миллиона последовательностей кожной РНК.
Анализ связал последовательности мышечной РНК с 236 генами, включая те, которые производят белки, такие как актин и тайтин, которые отвечают за растяжение и сокращение.
Образцы кожи соответствовали 270 генам, в том числе гену, который вырабатывает кератин — белок, образующий прочное покрытие кожи, волос и ногтей. Интересно, что команде даже удалось идентифицировать несколько фрагментов молекул РНК, которые, по-видимому, происходят от вирусов, обитавших внутри тилацина или на нем.
Это исследование помогает составить более полную картину о тилацине, давая лучшую основу для возрождения этого животного.
Тем не менее, конечно, до этого еще довольно далеко, если вообще возможно. Между тем, новая работа предполагает, что другие музейные образцы могут скрывать пригодные для использования молекулы РНК, которые могут дать новую ценную информацию.
Исследование было опубликовано в журнале Genome Research.